Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRBA1A5PL33 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRBA1A5PL33 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRBA1A5PL33 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRBA1A5PL33 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRBA1A5PL33 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRBA1A5PL33 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRBA1A5PL33 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KRBA1A5PL33 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRBA1A5PL33 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRBA1A5PL33 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRBA1A5PL33 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRBA1A5PL33 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRBA1A5PL33 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRBA1A5PL33 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRBA1A5PL33 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRBA1A5PL33 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRBA1A5PL33 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KRBA1A5PL33 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRBA1A5PL33 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRBA1A5PL33 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRBA1A5PL33 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRBA1A5PL33 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRBA1A5PL33 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.2 ms