Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
XIRP2A4UGR9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XIRP2A4UGR9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms