Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ7

PRAMEF27, PRAME family member 27, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF27A3QJZ7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRAMEF27A3QJZ7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRAMEF27A3QJZ7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms