Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRAMEF22A3QJZ6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRAMEF22A3QJZ6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms