Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UBA6A0AVT1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBA6A0AVT1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBA6A0AVT1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBA6A0AVT1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBA6A0AVT1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBA6A0AVT1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA6A0AVT1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA6A0AVT1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA6A0AVT1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA6A0AVT1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA6A0AVT1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA6A0AVT1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA6A0AVT1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA6A0AVT1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA6A0AVT1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA6A0AVT1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA6A0AVT1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA6A0AVT1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA6A0AVT1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBA6A0AVT1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms