Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVM2

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVM2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1B0GVM2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A1B0GVM2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GVM2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms