Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 RPL27A-201ENST00000314138 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 TCF21-202ENST00000367882 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PRKAG2-202ENST00000392801 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ST3GAL6-202ENST00000394162 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 RIPK3-201ENST00000216274 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AIMP2-201ENST00000223029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 WASF2-202ENST00000618852 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 TMUB2-203ENST00000446571 1580 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ACSF3-218ENST00000614302 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 DIDO1-205ENST00000370371 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PTPRD-AS2-201ENST00000429581 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PKM-222ENST00000568883 1863 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 LINC01561-201ENST00000369071 2176 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 TNS1-220ENST00000611415 6509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 INTS8-217ENST00000523731 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 BET1-201ENST00000222547 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PMEL-201ENST00000449260 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 OAS1-208ENST00000551241 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 RAB43-204ENST00000393307 4203 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 MADD-207ENST00000402799 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AL162231.4-201ENST00000564224 3264 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC084855.2-201ENST00000559400 2393 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 TMEM136-202ENST00000375095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 NEPRO-201ENST00000314400 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 EPB41L5-201ENST00000263713 6628 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 MVP-201ENST00000357402 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 SERPINB8-209ENST00000636430 1719 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 POLE-207ENST00000535270 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 SPRYD3-204ENST00000547837 1655 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 SLC5A10-201ENST00000317977 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ZNF544-208ENST00000596825 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 CSF3R-204ENST00000373104 2953 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC237221.1-202ENST00000563054 2947 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 MARCH5-201ENST00000358935 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 RNF13-201ENST00000344229 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 CAMK2B-209ENST00000395749 4447 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 STXBP1-220ENST00000637521 2068 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PKD1L2-210ENST00000533478 5669 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 SMCR5-201ENST00000543475 2844 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 SYCE3-201ENST00000402753 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC105935.1-203ENST00000419183 600 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 NLRP7-206ENST00000588756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PEG3-202ENST00000593695 4741 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 EIF3A-203ENST00000541549 4495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 CALM1-201ENST00000356978 4242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 DGKH-203ENST00000379274 4202 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 NAB1-203ENST00000409641 2472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 FSCN3-201ENST00000265825 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC016831.5-201ENST00000605249 1998 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ENOSF1-203ENST00000383578 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC010422.6-201ENST00000593682 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 SIGLEC11-203ENST00000447370 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 STAG1-203ENST00000434713 5064 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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