Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 SPTLC1-201ENST00000262554 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 TGOLN2-206ENST00000444342 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 ABCB8-222ENST00000542328 4371 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 LDLR-207ENST00000558013 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AC241952.1-201ENST00000612480 6897 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 RPS15P5-201ENST00000449885 432 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AP003170.2-201ENST00000544730 786 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 SCN8A-208ENST00000599343 5976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 ARRB2-207ENST00000571206 1659 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AC135050.1-201ENST00000622229 3380 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 FAM95C-205ENST00000637556 2421 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 ALOX5-201ENST00000374391 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 LDLRAD1-203ENST00000420619 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 GPATCH2L-212ENST00000557263 1458 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 DCAF6-203ENST00000367843 3302 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 LINC01544-201ENST00000567801 5168 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 EIF3A-203ENST00000541549 4495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 TSGA10-201ENST00000355053 3037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 NEPRO-201ENST00000314400 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 RCHY1-201ENST00000324439 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 TSPEAR-201ENST00000323084 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 PTGFR-202ENST00000370757 4379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 SLC25A30-207ENST00000539591 3608 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 MIPEPP1-201ENST00000413533 2027 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 SUOX-203ENST00000394109 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 LINC00523-206ENST00000556697 2071 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 DLX5-201ENST00000222598 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 CXorf40B-203ENST00000370406 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AC007598.3-201ENST00000623077 1678 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 DDR1-224ENST00000376567 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AC114781.1-201ENST00000450559 1028 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 AC012146.4-201ENST00000575546 271 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TMEM225BP0DP42 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms