Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AK7-201ENST00000267584 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 C4orf50-201ENST00000324058 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 PEX5L-213ENST00000476138 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 NDUFAF6-202ENST00000396113 2549 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 ZBED9-201ENST00000452236 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 ACTR1A-201ENST00000369905 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 BMP4-205ENST00000558984 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 PAX6-245ENST00000638914 7300 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 SIRT1-204ENST00000432464 3587 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 RORC-201ENST00000318247 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 DPY19L2P3-201ENST00000414296 2326 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 PDLIM5-206ENST00000437932 5713 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 TGM5-201ENST00000220420 2767 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 TGM5-205ENST00000610827 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 C14orf119-201ENST00000319074 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 USP31-201ENST00000219689 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 GK-207ENST00000427190 4573 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 MPRIP-205ENST00000395811 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 PPFIA2-214ENST00000549325 4727 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 ASB9-202ENST00000380485 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 TNRC6C-202ENST00000335749 9740 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 RNF17-202ENST00000255325 2134 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 BGN-201ENST00000331595 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 METTL4-203ENST00000574538 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 CAPRIN1-202ENST00000389645 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 MEGF8-203ENST00000378073 11034 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 MEMO1-201ENST00000295065 4505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 BCL2L13-215ENST00000611738 4817 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 TGFA-201ENST00000295400 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 SLC2A5-202ENST00000377424 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 CHERP-203ENST00000546361 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 TMCC2-203ENST00000358024 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AC111182.1-201ENST00000588701 3419 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 SLC44A4-203ENST00000375562 2505 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 PTCD2-211ENST00000536805 1911 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 MSRA-202ENST00000382490 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 MIR194-2HG-201ENST00000413053 3647 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 OR13A1-202ENST00000536058 2023 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 CAPRIN2-201ENST00000298892 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 SYBU-222ENST00000529175 2717 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 NEK6-212ENST00000539416 2582 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AC113391.1-201ENST00000507236 578 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 TRMT112P6-201ENST00000599234 372 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AL160287.1-203ENST00000637960 1061 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 UBE2V1-207ENST00000420027 1956 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 RBM7-203ENST00000540163 4243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 MIS12-206ENST00000611091 2691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 ORAI2-210ENST00000611770 10679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 FAM47A-202ENST00000613251 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 FCHO1-234ENST00000600676 3094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 Z98259.1-201ENST00000564261 1697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 MSH6-201ENST00000234420 7476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 SEMA4D-213ENST00000455551 3594 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 ADPRH-202ENST00000465513 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AL117378.1-201ENST00000454596 2305 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 LILRA2-204ENST00000391738 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AL162591.1-201ENST00000424435 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 BACH2-210ENST00000537989 9108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 NTM-221ENST00000539799 2550 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 KRT36-201ENST00000328119 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 MCM7-201ENST00000303887 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 METTL3-201ENST00000298717 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 KIAA1671-201ENST00000358431 10490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 SALL4-201ENST00000217086 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 EPB41L1-203ENST00000373941 2652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SMIM3Q9BZL3 AARS-201ENST00000261772 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms