Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 ZC3H10-201ENST00000257940 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 DNMBP-201ENST00000324109 6400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ASPH-205ENST00000445642 3717 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 FAM114A2-211ENST00000520667 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ENPP4-201ENST00000321037 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 HYLS1-202ENST00000425380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 WDR83OS-202ENST00000596731 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 METTL3-201ENST00000298717 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PLXNA4-203ENST00000378539 2004 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 FP325332.1-201ENST00000624818 2045 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 UBE2V1-207ENST00000420027 1956 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 CDK5RAP3-202ENST00000536708 1975 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 GOLGA4-202ENST00000361924 7772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PI4KB-202ENST00000368873 3340 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 IFNAR2-205ENST00000404220 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 NUTM2A-AS1-208ENST00000446751 2394 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 C2orf69-201ENST00000319974 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 CCDC114-201ENST00000315396 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 TUBB8P5-201ENST00000445286 1351 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 TMEM86A-201ENST00000280734 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 LINC01227-205ENST00000567317 1338 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 TRIM46-201ENST00000334634 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 DZANK1-201ENST00000262547 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 MAGEB1-202ENST00000397548 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PDIK1L-204ENST00000619836 4252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 RUFY4-202ENST00000374155 2977 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 RPS7-202ENST00000403564 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AL357140.1-201ENST00000454104 424 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 TRMT112P6-201ENST00000599234 372 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ZNF542P-207ENST00000495307 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 KCNA4-201ENST00000328224 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 POTEI-203ENST00000631234 2072 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 CCDC129-201ENST00000319386 4544 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 HSPBAP1-201ENST00000306103 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 DERL1-202ENST00000405944 1994 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 TAF7L-202ENST00000356784 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 DDX56-204ENST00000431640 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 STXBP1-221ENST00000637953 3925 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AGO2-205ENST00000519980 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 FLT4-202ENST00000393347 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC245100.6-201ENST00000427169 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 TMEM132D-201ENST00000389441 5305 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 SNRNP48-201ENST00000342415 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 HHIPL2-201ENST00000343410 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 NANP-201ENST00000304788 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 2500 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 OPRK1-206ENST00000613482 4682 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 SHC1-203ENST00000368449 2879 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 LILRA2-204ENST00000391738 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AL109976.1-201ENST00000621919 5678 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 AC120024.4-201ENST00000624285 2143 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 PLAGL1-209ENST00000444202 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 MADD-209ENST00000406482 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ARHGAP36-202ENST00000370921 2447 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 OTOF-204ENST00000402415 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 MIPEPP1-201ENST00000413533 2027 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 UBXN4-201ENST00000272638 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 MAMLD1-201ENST00000262858 4607 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NICN1Q9BSH3 INAVA-201ENST00000367342 4298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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