Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 IL18BP-202ENST00000337131 1606 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 RGL4-210ENST00000615003 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 GOLGA6L10-208ENST00000619556 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 B4GALT1-201ENST00000379731 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 TSPAN2-202ENST00000369516 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 ACSBG1-214ENST00000560817 2462 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 TMEM106B-202ENST00000396668 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AC140481.3-201ENST00000450440 1762 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 ATAD2-201ENST00000287394 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 BCAR3-202ENST00000370243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 PLEKHM1P1-205ENST00000582986 5014 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 CD44-209ENST00000433892 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 DHRS4-AS1-205ENST00000556379 2852 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 ZNF442-203ENST00000438182 1906 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 ANGEL1-201ENST00000251089 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 DCBLD2-202ENST00000326857 3959 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 THAP9-AS1-202ENST00000504520 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 CAPN9-203ENST00000366666 2173 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 LRG1-201ENST00000306390 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 FRG2DP-203ENST00000569028 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 AP2A1-202ENST00000359032 3286 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 KRT40-201ENST00000377755 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 PTCH1-207ENST00000429896 6563 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 CSPG4P12-201ENST00000558282 4853 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 TLE3-213ENST00000558379 2304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
LSAMPQ13449 STXBP1-218ENST00000637173 4193 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 PAX4-208ENST00000639438 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 IQSEC1-205ENST00000618604 3744 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 B3GALT5-201ENST00000343118 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 UQCC1-203ENST00000374380 2133 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 LINC00342-202ENST00000448494 2351 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AC005549.1-201ENST00000579438 1629 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AL365259.1-204ENST00000606001 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 CLN8-212ENST00000637083 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AC098679.1-201ENST00000503611 2917 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 MSANTD4-201ENST00000301919 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AC100788.1-201ENST00000591108 945 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 A2M-AS1-201ENST00000499762 2192 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 THEGL-202ENST00000512175 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 IPO13-202ENST00000372343 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ZNF75D-202ENST00000370766 5592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 NCL-201ENST00000322723 4034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ICOS-201ENST00000316386 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 KIAA0319L-202ENST00000373266 2377 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 BCL6-202ENST00000406870 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 SIGLEC6-206ENST00000436458 1713 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 PLOD1-201ENST00000196061 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ZWINT-204ENST00000395405 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 SNX1-211ENST00000560829 1869 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 KLF8-202ENST00000374928 4821 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AC006372.3-201ENST00000444158 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 ZNF304-203ENST00000443917 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 AF131215.6-201ENST00000602575 2014 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 NNMT-201ENST00000299964 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 RHBDD1-201ENST00000341329 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LSAMPQ13449 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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