Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 NDUFS5-201ENST00000372967 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 NDUFS5-202ENST00000372969 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 416 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 AC098934.2-202ENST00000438944 1033 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 AC102953.1-201ENST00000445345 498 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 KRT18P42-201ENST00000505048 1255 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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PTPRJQ12913 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 ETFBKMT-205ENST00000538463 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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PTPRJQ12913 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 MOG-225ENST00000431798 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 ELP4-225ENST00000640533 1801 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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PTPRJQ12913 SCHIP1-201ENST00000445224 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 AL109615.2-201ENST00000455005 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 LSM8-201ENST00000249299 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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PTPRJQ12913 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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PTPRJQ12913 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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PTPRJQ12913 MPPE1-202ENST00000317235 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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PTPRJQ12913 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 DNASE1L3-207ENST00000486455 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 STRADA-202ENST00000336174 2255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 GRIA4-202ENST00000393125 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 LYPD5-201ENST00000377950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 PKMP1-201ENST00000455804 1523 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPRJQ12913 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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