Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
U3KQE9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
U3KQE9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
U3KQE9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
U3KQE9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
U3KQE9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
U3KQE9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
U3KQE9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
U3KQE9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
U3KQE9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
U3KQE9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
U3KQE9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
U3KQE9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
U3KQE9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
U3KQE9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
U3KQE9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
U3KQE9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
U3KQE9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
U3KQE9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
U3KQE9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
U3KQE9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
U3KQE9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
U3KQE9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
U3KQE9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
U3KQE9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
U3KQE9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
U3KQE9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
U3KQE9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
U3KQE9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
U3KQE9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
U3KQE9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
U3KQE9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
U3KQE9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
U3KQE9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
U3KQE9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
U3KQE9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
U3KQE9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
U3KQE9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
U3KQE9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
U3KQE9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
U3KQE9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
U3KQE9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
U3KQE9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
U3KQE9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
U3KQE9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
U3KQE9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
U3KQE9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
U3KQE9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
U3KQE9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
U3KQE9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
U3KQE9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
U3KQE9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
U3KQE9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
U3KQE9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
U3KQE9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
U3KQE9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
U3KQE9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
U3KQE9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
U3KQE9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
U3KQE9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
U3KQE9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
U3KQE9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
U3KQE9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
U3KQE9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
U3KQE9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
U3KQE9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
U3KQE9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
U3KQE9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
U3KQE9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
U3KQE9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
U3KQE9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
U3KQE9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
U3KQE9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
U3KQE9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
U3KQE9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
U3KQE9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
U3KQE9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
U3KQE9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
U3KQE9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
U3KQE9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
U3KQE9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
U3KQE9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
U3KQE9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
U3KQE9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
U3KQE9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
U3KQE9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
U3KQE9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
U3KQE9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
U3KQE9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
U3KQE9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
U3KQE9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
U3KQE9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
U3KQE9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
U3KQE9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
U3KQE9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
U3KQE9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
U3KQE9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
U3KQE9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
U3KQE9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
U3KQE9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms