Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CAMTA1Q9Y6Y1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAMTA1Q9Y6Y1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms