Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms