Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRPRBQ9Y5M8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRPRBQ9Y5M8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms