Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP15Q9Y4E8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP15Q9Y4E8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms