Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B7

MRPL11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL11Q9Y3B7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRPL11Q9Y3B7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MRPL11Q9Y3B7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms