Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED7Q9Y3B3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED7Q9Y3B3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms