Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRG3Q9Y2Y8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms