Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP20Q9Y2K6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms