Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GINS2Q9Y248 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GINS2Q9Y248 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms