Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQR0

SCML2, Sex comb on midleg-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML2Q9UQR0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCML2Q9UQR0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms