Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIAA1024Q9UPX6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIAA1024Q9UPX6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms