Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX12Q9UMY4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX12Q9UMY4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX12Q9UMY4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms