Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULZ9

MMP17, Matrix metalloproteinase-17, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17Q9ULZ9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MMP17Q9ULZ9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MMP17Q9ULZ9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP17Q9ULZ9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP17Q9ULZ9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP17Q9ULZ9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP17Q9ULZ9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP17Q9ULZ9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP17Q9ULZ9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP17Q9ULZ9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP17Q9ULZ9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP17Q9ULZ9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP17Q9ULZ9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP17Q9ULZ9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP17Q9ULZ9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP17Q9ULZ9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP17Q9ULZ9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP17Q9ULZ9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP17Q9ULZ9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP17Q9ULZ9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP17Q9ULZ9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms