Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FZD4Q9ULV1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FZD4Q9ULV1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms