Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH7Q9ULB5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH7Q9ULB5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms