Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC9Q9UKV0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HDAC9Q9UKV0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC9Q9UKV0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms