Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PACSIN3Q9UKS6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PACSIN3Q9UKS6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms