Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNMT3LQ9UJW3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT3LQ9UJW3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms