Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RIMS3Q9UJD0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RIMS3Q9UJD0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RIMS3Q9UJD0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RIMS3Q9UJD0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RIMS3Q9UJD0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RIMS3Q9UJD0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RIMS3Q9UJD0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RIMS3Q9UJD0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RIMS3Q9UJD0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RIMS3Q9UJD0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RIMS3Q9UJD0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RIMS3Q9UJD0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RIMS3Q9UJD0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RIMS3Q9UJD0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RIMS3Q9UJD0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RIMS3Q9UJD0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RIMS3Q9UJD0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RIMS3Q9UJD0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RIMS3Q9UJD0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RIMS3Q9UJD0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RIMS3Q9UJD0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RIMS3Q9UJD0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RIMS3Q9UJD0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RIMS3Q9UJD0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RIMS3Q9UJD0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RIMS3Q9UJD0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RIMS3Q9UJD0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RIMS3Q9UJD0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RIMS3Q9UJD0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RIMS3Q9UJD0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RIMS3Q9UJD0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms