Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIX4Q9UIU6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIX4Q9UIU6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SIX4Q9UIU6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms