Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP25Q9UHP3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP25Q9UHP3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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