Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXO40Q9UH90 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms