Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VTI1BQ9UEU0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VTI1BQ9UEU0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VTI1BQ9UEU0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms