Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNAL1Q9UBT7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNAL1Q9UBT7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms