Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
POLKQ9UBT6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
POLKQ9UBT6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLKQ9UBT6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms