Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNG4Q9UBN1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms