Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MBD2Q9UBB5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MBD2Q9UBB5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms