Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
LRP2BPQ9P2M1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms