Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RRBP1Q9P2E9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RRBP1Q9P2E9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RRBP1Q9P2E9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms