Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E8

MARCH4, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH4Q9P2E8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MARCH4Q9P2E8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARCH4Q9P2E8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms