Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKD2L1Q9P0L9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121 ms