Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NDUFA13Q9P0J0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFA13Q9P0J0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms