Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBP1Q9NZI7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
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