Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GDE1Q9NZC3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GDE1Q9NZC3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDE1Q9NZC3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
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