Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA3

GOLGA6A, Golgin subfamily A member 6A, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6AQ9NYA3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA6AQ9NYA3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA6AQ9NYA3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184 ms