Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF38Q9NXL2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF38Q9NXL2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF38Q9NXL2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF38Q9NXL2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGEF38Q9NXL2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF38Q9NXL2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF38Q9NXL2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF38Q9NXL2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF38Q9NXL2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF38Q9NXL2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF38Q9NXL2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF38Q9NXL2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF38Q9NXL2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF38Q9NXL2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF38Q9NXL2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF38Q9NXL2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF38Q9NXL2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF38Q9NXL2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF38Q9NXL2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF38Q9NXL2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGEF38Q9NXL2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF38Q9NXL2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF38Q9NXL2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF38Q9NXL2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF38Q9NXL2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF38Q9NXL2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF38Q9NXL2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF38Q9NXL2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGEF38Q9NXL2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGEF38Q9NXL2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms