Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MS4A12Q9NXJ0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MS4A12Q9NXJ0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms